Вы можете просто сообщить о появлении нового сайта:
Яндкс: http://webmaster.yandex.ru/addurl.xml
Google: https://www.google.com/webmasters/tools/submit-url (нужна регистрация в Гугле)
Или зарегистрировать свой сайт в инструментах для вебмастеров:
Яндекс вебмастер: http://webmaster.yandex.ru/
Гугл вебмастер: https://www.google.com/webmasters/tools/home?hl=ru
Для подтверждения прав на сайт при регистрации в инструментах для вебмастеров:
1) Выберите способ подтверждения — через Мета-тег. Скопируйте код, который предоставит вам сервис.
2) Откройте сайт на 4 шаге Сайткрафта.
3) Нажмите "Настройка страниц" - "Доп.инструменты" .
4) Выберите Лицевую страницу вашего сайта.
5) Нажмите "Добавить код" и вставьте строчку кода
Вам может быть предложен способ подтверждения прав на сайт "через HTML код". Как вставить в сайт HTML код читайте в подсказке:
support.sitecraft.ru/feature/Ustanovka_vneshnih_skriptov/ustanovka.htm
P.S. Если у вас есть электронная почта на Яндексе или Гугле, вы можете использовать уже существующие аккаунты, а не создавать новые.